Zoologisk Have er samarbejdspartner i et EU-Life projekt om genudsætning af den akut truede klokkefrø. Genudsætningen foregår på Hjortø i det sydfynske ø-hav. Zoo har ansvaret for opdræt af yngel, som kan genudsættes i de kunstigt genskabte søer på Hjortø.
I 2010 blev der i alt udsat 742 haletudser på Hjortø. Udsætningen foregik fra slutningen af juni til midt i juli. Samtidig kunne det konstateres, at de forbedringer, der blev foretaget af frøernes levesteder sidste år havde båret frugt.
I efteråret og vinteren 2009/10 blev der på Hjortø gravet en del nye vandhuller; eksisterende vandhuller blev gravet større, og render mellem vandhullerne blev genoprettet. Frøerne kvitterede ved hurtigt at tage dem i brug. Renderne syntes at virke som transportvej mellem vandhullerne på øens østside og er således med til at fremme spredningen af frøerne i området.
Projektet omfatter nu også strandtudser og løgfrøer.